福建衛生職業技術學院是一所經福建省人民政府批準設置、教育部備案的公辦全日制普通高等學校，主要培養護理、藥學、醫學技術、臨床醫學、衛生管理類技術技能型醫藥衛生人才，2005年由福建衛生學校和福州衛生學校合并組建，隸屬福建省教育廳。學院的前身是創辦于1912年的福州馬高愛醫院附設看護學校，是中國首批注冊的護士學校之一。學院于1954年開辦藥學和醫學檢驗專業，是福建省最早的藥學和醫學檢驗人才培養基地，并于1986年在全省醫藥衛生院校中率先開設醫學影像專業。

學院內設機構20個，其中黨政管理機構11個，教學機構7個，教輔機構2個。教職工351人，其中專任教師204人，教授9人，博士碩士141人。兼職教師595人。現有全日制學歷在校生8870人，其中高職7433人，中職1437人。現有專業20個，覆蓋醫學及相關醫學專業，形成了門類齊全的醫藥衛生高職教育專業群。其中，省級精品專業3個（護理、藥學、醫學檢驗技術），省高等職業教育示范專業6個（護理、藥學、醫學檢驗技術、醫學影像技術、助產、中藥），醫學檢驗技術、醫學影像技術專業獲得“教育部支持高等職業學校提升專業服務產業發展能力項目”驗收。學院現有校內實訓基地11個，其中中央財政支持的高等職業教育實訓基地3個，福建省高等職業教育生產性實訓基地5個。校外實踐基地173個，其中直屬附屬醫院1個，非直屬附屬醫院5個，教學醫院17個。學院是承擔福建省現代大學制度改革試點單位唯一一所高職院校，創新“政府主導、行業指導、企業參與、學校主體”的合作共建模式，與行業部門、龍頭醫院、知名企業聯合辦學。建立了12個廠中校，合作舉辦一批校企合作班。畢業生就業率穩定在99%以上。

學院科研創新注重應用性科研和高職教育研究，成立生物醫藥福建省高校應用技術工程中心、福建省中醫藥有效成分分析與生物活性評價研究室、延續護理福建省高校應用文科研究中心。年來致力于國家三類新藥伏立諾他原料及其膠囊制劑、養心草安神膠囊等應用性項目的開發。高職教育研究取得國家級、省級成果。獲得國家級教學成果二等獎1項、全國衛生行指委教學成果二等獎1項，福建省教學成果特等獎1項，一等獎2項、二等獎1項。

學院主動服務區域經濟社會發展，開展技術培訓、技術服務和教育交流。接收了福建省衛生計生委培訓中心。牽頭成立福建省基層衛生技術人員培訓集團（常務理事單位37個，理事單位100個）,設有福建省基層衛生技術人員培訓基地、鄉鎮衛生技術人員培訓中心和鄉村醫生培訓中心。面向基層開展鄉村醫生規范化培訓、護理人員培訓等，面向企業職工開展在崗培訓和技能鑒定等，年培訓3.5萬人次。與企業合作成立聯合研究中心，為企事業單位提供技術服務、技術咨詢。學院持續拓展教育交流合作。在省內與三明職業技術學院、福清衛校、龍巖衛校、閩東衛校聯辦中職階段自考大專學歷銜接教育；在國內與天津醫學高等專科學校、新疆昌吉職業技術學院、青海衛生職業技術學院等省內外高職院校結為友好合作伙伴學校；在國（境）外與美國、日本、菲律賓、泰國、臺灣、香港、澳門等國（境）外十余所高校建立了合作關系，并在福建省高職院校中舉辦首個中外合作護理教育合作項目。

學院全面貫徹黨的教育方針，堅持以育人為中心，努力踐行“業精德誠”的校訓精神，為福建省醫藥衛生事業發展做出了應有的貢獻。在2008年教育部高職高專人才培養工作水評估中獲得優秀。2011年底，被省教育廳、省發改委、省財政廳確定為省級示范性高等職業院校建設單位。年來被授予“全省高校就業工作評估優秀單位”、“全省高校政治教育評估優秀單位”、“省安校園”、“安先行學校”、“省模范職工之家”、“省直文明單位”等榮譽稱號。2017年初，被省教育廳、省財政廳確定為福建省示范性現代職業院校建設工程A類培育院校。