第一、清華和北大最大的區別就在于學科側重點不同
清華大學和北京大學居然都是綜合性大學，但是所發展的學科側重點是不一樣的，清華大學的工科實力突出，主要以發展工科為主，也可以說清華大學是我國工科實力最強的一所高校，根據教育部第4輪高校學科評估結果，我們可以發現清華大學的工科很多都被評選為A類學科。
而北京大學的學科發展側重點則主要集中在文理學科上，因此清華北大最大的區別就在于各自的學科實力不一樣，更直白地來說，清華大學偏向于技術性、應用性和工程性，而北京大學則是偏向于理論性、科學性以及基礎性。
因此對于理科生來說，可能會更青睞于選擇清華大學，而對于文科生來說，則會比較傾向于選擇北京大學。
第二、單一的學科對比也存在不同
若是從單一的學科來對比清華北大，也是有比較大的區別的，清華大學所擁用的頂尖學科，比如清華大學在信息、材料、能源、建筑、環境等工科實力上所占據的優勢，是北京大學不能夠媲美的，反過來，北京大學所擁有的頂尖學科，清華大學也比不上。
第三、各自的文化底蘊不同
除了學科實力的差距以外，清華大學和北京大學之間的區別也在于各自的文化底蘊不同，清華大學所追求的文化與北京大學所追求的文化是有區別的，清華大學所追求的文化是創新、求實，所追求的是一種實干的精神，有的人則認為北京大學所追求的文化是華而不實的。
當然除了上面這些方面的不同以外，清華大學和北京大學在師資水、生源質量、學科創新能力、招生政策、錄取分數線、專業實力、科研資金投入的比例等方面都是存在區別的，清華大學和北京大學所取得的教學成果以及科研成果也存在比較大的區別。
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