區別如下：
一、錄取順序不同
1、本科一批二志愿：本科一批二志愿的錄取順序為先于本科一批三志愿和本科二批。
2、本科一批三志愿：本科一批三志愿的錄取順序為晚于本科一批二志愿，先于本科二批。
3、本科二批：本科二批的錄取順序為晚于本科一批二志愿和本科一批三志愿。
二、錄取大學不同
1、本科一批二志愿：本科一批二志愿的錄取大學為重點本科大學。
2、本科一批三志愿：本科一批三志愿的錄取大學為重點本科大學。
3、本科二批：本科二批的錄取大學為二本本科大學。
三、招生不同
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1、本科一批二志愿：本科一批二志愿由全國各部委直屬高校和一些在全國有較大影響力的重點高校招生。
2、本科一批三志愿：本科一批三志愿由全國各部委直屬高校和一些在全國有較大影響力的重點高校招生。
3、本科二批：本科二批由普通本科院校招生。
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